《机动战士高达00第二季》延续了第一季的剧情,讲述了天人组织与三大势力之间的斗争。在第二季中,天人组织面临着更加严峻的挑战,三大势力也加大了对天人的围剿力度。
在第二季的开头,天人组织的成员们遭到了三大势力的联合攻击,组织总部被摧毁,许多成员牺牲。天人组织的领导人刹那·F·清英在这次攻击中幸免于难,他决心重建天人组织,并继续与三大势力斗争。
在天人组织重建后,刹那·F·清英率领天人组织的成员们展开了新的战斗。他们与三大势力展开了激烈的交火,并取得了一系列的胜利。然而,三大势力也并非等闲之辈,他们在战斗中也给天人组织造成了不小的损失。